Joanna Gaca-Wyczółkowska z wydawnictwem związana jest od 2000 r., a od 15 lat zarządza zespołami pracowników w tej placówce, kolejno pełniąc funkcje: kierownika redakcji publikacji nieperiodycznych, sekretarza wydawnictwa, zastępcy dyrektora ds. wydawniczych.

Od października 2022 r. była pełniącą obowiązki dyrektora WMP. Z dniem 1 października 2023 r. została powołana na stanowisko dyrektorki WMP, na 3-letnią kadencję.

Joanna Gaca-Wyczółkowska zna dobrze rynek wydawniczy, ma wieloletnie doświadczenie w pracy edytorskiej (w tym w inicjowaniu nowych tytułów oraz aktywnej pracy przy redagowaniu tekstów). Stworzyła program edukacyjny WMP oraz staży studenckich w wydawnictwie, w którego realizacji uczestniczyła i uczestniczy. Zainicjowała dział wydawnictw dla dzieci, który nadal rozwija. 

Jest jurorką konkursów literackich wydawnictwa oraz konkursu im. Marii Dokowicz organizowanego przez Uniwersytet Artystyczny im. Magdaleny Abakanowicz w Poznaniu. Należy do gremiów eksperckich na Uniwersytecie im. Adama Mickiewicza.